The Sharka disease caused by the Plum pox virus (PPV) is the most important virosis in stone fruit production. To prevent the spread of this virus reliable detection methods are required. Existing techniques are time consuming, laborious, costly, insensitive and/or require sophisticated technical equipment. To resolve these drawbacks, cascade rolling circle amplification (CRCA) and loop mediated isothermal amplification (LAMP) were examined for their applicability for the detection of PPV. CRCA proved to be insufficient. In contrast, LAMP allowed for reverse transcription of PPV RNA, DNA amplification and visualisation of DNA synthesis in a single reaction at a constant temperature. A fast extraction procedure simplified the sample preparation. The accuracy, the specificity, the sensitivity and the simplicity of this method regarding the high-throughput monitoring of PPV infection but also for subgroup differentiation was demonstrated.     «

The Sharka disease caused by the Plum pox virus (PPV) is the most important virosis in stone fruit production. To prevent the spread of this virus reliable detection methods are required. Existing techniques are time consuming, laborious, costly, insensitive and/or require sophisticated technical equipment. To resolve these drawbacks, cascade rolling circle amplification (CRCA) and loop mediated isothermal amplification (LAMP) were examined for their applicability for the detection of PPV. CRCA...     »

Die Scharka-Krankheit, bedingt durch das Plum pox virus (PPV), ist die bedeutendste Virose im Steinobstanbau. Um die Ausbreitung des Virus zu verhindern, werden zuverlässige Nachweismethoden benötigt. Vorhandene Verfahren sind zeit-, kosten- und arbeitsintensiv und/oder insensitiv. Um diese Nachteile zu vermeiden, wurden die Cascade rolling circle amplification (CRCA) und Loop mediated isothermal amplification (LAMP) bezüglich ihrer Eignung zum Nachweis von PPV getestet. CRCA erwies sich als ungeeignet. Dagegen ermöglichte LAMP die reverse Transkription von PPV RNA, DNA-Amplifikation und die Visualisierung der DNA-Synthese in einer einzelnen Reaktion bei einer konstanten Temperatur. Die Spezifität, die Sensitivität und die Einfachheit dieser Methode hinsichtlich des Hochdurchsatz-Monitoring von PPV-Infektionen wurde sowohl für den allgemeinen PPV Nachweis als auch für die Stammunterscheidung gezeigt.     «

Die Scharka-Krankheit, bedingt durch das Plum pox virus (PPV), ist die bedeutendste Virose im Steinobstanbau. Um die Ausbreitung des Virus zu verhindern, werden zuverlässige Nachweismethoden benötigt. Vorhandene Verfahren sind zeit-, kosten- und arbeitsintensiv und/oder insensitiv. Um diese Nachteile zu vermeiden, wurden die Cascade rolling circle amplification (CRCA) und Loop mediated isothermal amplification (LAMP) bezüglich ihrer Eignung zum Nachweis von PPV getestet. CRCA erwies sich als ung...     »