Tissue-specific gene (and protein) expression and its effects on protein-protein interaction networks in cancer and other complex diseases.
Übersetzter Titel:
Gewebespezifische Gen- (und Protein-) Expression und ihre Auswirkung auf die Protein-Protein-Interaktionsnetzwerke in Krebs und anderen komplexen Krankheiten.
Frishman, Dmitrij (Prof. Dr.); Cox, Jürgen (Prof., Ph.D.)
Sprache:
en
Fachgebiet:
BIO Biowissenschaften
Stichworte:
Isoform switching, edgetic perturbations, biomarker discovery, cancer, network rewiring, cell type specific protein (mRNA) expression
Übersetzte Stichworte:
Isoform switching, edgetische Störungen, Entdeckung von Biomarkern, Krebs, Netzwerk-Neuverdrahtung, Expression von zelltypspezifischem Protein (mRNA).
TU-Systematik:
BIO 110d
Kurzfassung:
The use of high throughput next-generation sequencing data advanced our understanding of cancer. Omics data integration with network data (protein-protein interaction networks, PPINs) is a novel way of studying diseases to find biomarkers. PPINs are vital in our understanding of the behavior of diseases and in the development of new therapies. This thesis aimed at identifying how differential isoform expression between cancer and healthy states may result in edgetic perturbations in cancer.
Übersetzte Kurzfassung:
Als neuartige Methode zur Untersuchung komplexer Krankheiten wurde die Integration von Sequenzierungsdaten der nächsten Generation und Omics Daten mit Protein-Protein-Interatkionsnetzwerken (PPINs) vorgeschlagen Biomarker zu identifizieren. PPINs spielen eine entscheidende Rolle für unser Verständnis Krankheiten, sowie bei der Entwicklung neuer Therapien. Diese Arbeit zielte darauf ab, herauszufinden wie unterschiedliche Isoformausprägungen zu randständigen Störungen bei Krebs führen können.