Quantitative proteomics requires methods that are accurate and precise. While software tools to process mass spectrometry data exist, they are often limited to only part of the complete analysis. Presented here is isobarQuant, a simple tool that implements new methods to perform accurate and precise MS1 and MS2 quantification. It also combines raw data and its interpretation into a single, easily accessible HDF5-indexed file. This open-source solution enables researchers to answer questions that had not yet been possible.
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Quantitative proteomics requires methods that are accurate and precise. While software tools to process mass spectrometry data exist, they are often limited to only part of the complete analysis. Presented here is isobarQuant, a simple tool that implements new methods to perform accurate and precise MS1 and MS2 quantification. It also combines raw data and its interpretation into a single, easily accessible HDF5-indexed file. This open-source solution enables researchers to answer questions that...
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Translated abstract:
Quantitative Proteomik erfordert Methoden, die akkurat und präzise sind. Es gibt viele Programme zur Verarbeitung von Massenspektrometriedaten, diese beschränken sich jedoch häufig nur auf einen Teil der vollständigen Analyse. Hier wird isobarQuant vorgestellt, ein leicht-bedienbares Programm, das eine akkurate und präzise MS1- und MS2-Quantifizierung ermoeglicht. Außerdem werden Rohdaten und ihre Interpretation in einer einzigen, leicht zugänglichen HDF5-indizierten Datei kombiniert. Diese Open-Source-Lösung steht Forschern zur Verfügung, um Fragen zu beantworten, die bisher außer Reichweite waren.
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Quantitative Proteomik erfordert Methoden, die akkurat und präzise sind. Es gibt viele Programme zur Verarbeitung von Massenspektrometriedaten, diese beschränken sich jedoch häufig nur auf einen Teil der vollständigen Analyse. Hier wird isobarQuant vorgestellt, ein leicht-bedienbares Programm, das eine akkurate und präzise MS1- und MS2-Quantifizierung ermoeglicht. Außerdem werden Rohdaten und ihre Interpretation in einer einzigen, leicht zugänglichen HDF5-indizierten Datei kombiniert. Diese Open...
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