Identification of overlapping genes in the human pathogens Escherichia coli LF82 and Pseudomonas aeruginosa PAO1 using transcriptomics, translatomics and proteomics
Übersetzter Titel:
Identifizierung überlappender Gene in den Humanpathogenen Escherichia coli LF82 und Pseudomonas aeruginosa PAO1 mittels Transkriptomik, Translatomik und Proteomik
Autor:
Kreitmeier, Michaela Veronika
Jahr:
2021
Dokumenttyp:
Dissertation
Fakultät/School:
TUM School of Life Sciences
Betreuer:
Scherer, Siegfried (Prof. Dr.)
Gutachter:
Scherer, Siegfried (Prof. Dr.); Liebl, Wolfgang (Prof. Dr.)
Sprache:
en
Fachgebiet:
BIO Biowissenschaften
TU-Systematik:
BIO 260
Kurzfassung:
The aim of this thesis was to identify novel intergenic as well as overlapping genes in the human pathogens Escherichia coli LF82 and Pseudomonas aeruginosa PAO1. For this purpose, various high-throughput methods including transcriptome sequencing as well as ribosome profiling were implemented for both organisms. The identified gene candidates were further characterized both bioinformatically and experimentally by additional experiments, e.g., mass spectrometric analyses.
Übersetzte Kurzfassung:
Ziel dieser Arbeit war es, sowohl neue intergenische als auch überlappende Gene in den Humanpathogenen Escherichia coli LF82 und Pseudomonas aeruginosa PAO1 zu identifizieren. Hierfür wurden verschiedenste Hochdurchsatz-Methoden wie z.B. Transkriptom-Sequenzierung und ribosome profiling für beide Organismen implementiert. Die identifizierten Gen-Kandidaten wurden sowohl bioinformatisch als auch experimentell durch zusätzliche Experimente wie z.B. massenspektrometrische Analysen näher charakterisiert.
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Ziel dieser Arbeit war es, sowohl neue intergenische als auch überlappende Gene in den Humanpathogenen Escherichia coli LF82 und Pseudomonas aeruginosa PAO1 zu identifizieren. Hierfür wurden verschiedenste Hochdurchsatz-Methoden wie z.B. Transkriptom-Sequenzierung und ribosome profiling für beide Organismen implementiert. Die identifizierten Gen-Kandidaten wurden sowohl bioinformatisch als auch experimentell durch zusätzliche Experimente wie z.B. massenspektrometrische Analysen näher charakteris...
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