In my thesis, I applied quantitative mass spectrometry-based proteomics to two important biological phenomena. Changes in human aneuploid cells in comparison to their diploid counterpart cells were analyzed on genome, transcriptome and proteome level. Specific as well as general regulation mechanisms were unraveled. For the investigation of TRAIL-induced apoptosis, I developed a SILAC-based approach to identify caspase-dependent cleavage events. I identified close to 700 cleaved substrates and performed further downstream analysis.     «

In my thesis, I applied quantitative mass spectrometry-based proteomics to two important biological phenomena. Changes in human aneuploid cells in comparison to their diploid counterpart cells were analyzed on genome, transcriptome and proteome level. Specific as well as general regulation mechanisms were unraveled. For the investigation of TRAIL-induced apoptosis, I developed a SILAC-based approach to identify caspase-dependent cleavage events. I identified close to 700 cleaved substrates and p...     »

Meine Arbeit umfasst quantitative Massenspektrometrie-basierende Proteomik, angewandt auf Aneuploidie und Apoptose. Unterschiedliche aneuploide humane Zelllinien wurden auf DNA, mRNA und Protein-Ebene untersucht. Spezifische als auch generelle Regulationsmechanismen wurden ermittelt. Ich entwickelte ferner eine Methode, um Proteine zu identifizieren, welche nach Apoptose-Induktion mittels TRAIL durch Caspasen geschnitten werden. Ich entdeckte nahezu 700 Caspase-Substrate und führte weitere Downstream-Analysen zu deren näheren Charakterisierung durch.     «

Meine Arbeit umfasst quantitative Massenspektrometrie-basierende Proteomik, angewandt auf Aneuploidie und Apoptose. Unterschiedliche aneuploide humane Zelllinien wurden auf DNA, mRNA und Protein-Ebene untersucht. Spezifische als auch generelle Regulationsmechanismen wurden ermittelt. Ich entwickelte ferner eine Methode, um Proteine zu identifizieren, welche nach Apoptose-Induktion mittels TRAIL durch Caspasen geschnitten werden. Ich entdeckte nahezu 700 Caspase-Substrate und führte weitere Downs...     »