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Original title:
GenomeZipper - a bioinformatic approach to unravel highly complex cereal genomes
Translated title:
GenomeZipper - eine bioinformatische Methode zur Analyse von komplexen Grasgenomen
Author:
Martis, Mihaela-Maria
Year:
2015
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
Advisor:
Mewes, Hans-Werner (Prof. Dr.)
Referee:
Mewes, Hans-Werner (Prof. Dr.); Schön, Chris-Carolin (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften; LAN Landbauwissenschaft
Keywords:
GenomeZipper, grass genomes, rye B chromosomes
Translated keywords:
GenomeZipper, Gräser, B Chromosomen in Roggen
TUM classification:
BIO 110d
Abstract:
This thesis provides a new tool termed GenomeZipper which aims to identify, order and structure chromosomal survey sequences of large grass genomes that lack physical maps by exploiting the widely conserved synteny among grasses. Subsequent comparative analyses performed on the GenomeZipper results are described, too. In addition, this work highlights the evolution and composition of rye B chromosomes.
Translated abstract:
Im Rahmen dieser Arbeit wird eine neue Methode vorgestellt (GenomeZipper), welche die konservierte Syntänie zwischen Gräsern ausnutzt, um Gensequenzen von Grasgenomen, ohne physikalische Karte, entlang von Chromosomen anzuordnen. Die erstellten virtuellen Genkarten werden verwendet, um vergleichende Analysen zwischen Gräsern durchzuführen. Des Weiteren geben die Ergebnisse dieser Arbeit Einblicke in die Evolution und Zusammensetzung des B Chromosoms in Roggen.
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1234110
Date of submission:
23.03.2015
Oral examination:
29.06.2015
File size:
7767004 bytes
Pages:
149
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20150629-1234110-1-8
Last change:
15.07.2015
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