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- Originaltitel:
- Efficient HPC Implementations for Large-Scale Molecular Simulation in Process Engineering
- Übersetzter Titel:
- Effiziente HPC-Implementierungen für hoch-skalierbare Molekulardynamik-Simulation in der Verfahrenstechnik
- Autor:
- Eckhardt, Wolfgang Florian
- Jahr:
- 2014
- Dokumenttyp:
- Dissertation
- Fakultät/School:
- Fakultät für Informatik
- Betreuer:
- Bungartz, Hans-Joachim (Prof. Dr.)
- Gutachter:
- Bungartz, Hans-Joachim (Prof. Dr.); Resch, Michael M. (Prof. Dr. Dr. h.c.)
- Sprache:
- en
- Fachgebiet:
- DAT Datenverarbeitung, Informatik
- Stichworte:
- Molecular Dynamics, High-Performance-Computing, Vectorisation, Linked-Cells Algorithm, Ewald summation, Fast-Multipole Method
- Übersetzte Stichworte:
- Molekulardynamik, Hochleistungsrechnen, Vektorisierung, Linked-Cells Algorithmus, Ewald Summation, Fast-Multipole Methode
- Kurzfassung:
- This thesis presents enhancements of algorithms for molecular dynamics simulation together with efficient hardware-aware implementations. It focuses on optimisation strategies for short- and long-range molecular interactions on current CPU and GPU hardware as well as software-related aspects. The developments have been integrated into the code Mardyn, a powerful tool for large-scale MD simulations in process engineering, which allowed to perform the world's largest MD simulation in 2013.
- Übersetzte Kurzfassung:
- Diese Arbeit präsentiert algorithmische Weiterentwicklungen für Molekulardynamiksimulationen mit den dazugehörigen Implementierungen. Sie konzentriert sich auf die Optimierung kurz- und langreichweitiger intermolekularer Interaktionen auf aktuellen CPUs und GPUs, sowie softwaretechnische Aspekte. Die Entwicklungen wurden in den Code Mardyn integriert, ein leistungsfähiges Werkzeug für hochparallele MD-Simulationen, mit dessen Hilfe 2013 die weltgrößte MD Simulation ausgeführt werden konnte.
- ISBN:
- 978-3-8439-1746-9
- WWW:
- https://mediatum.ub.tum.de/?id=1218424
- Eingereicht am:
- 28.05.2014
- Mündliche Prüfung:
- 23.07.2014
- Letzte Änderung:
- 03.11.2014
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