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Original title:
Stochastic and deterministic methods for the analysis of Nanog dynamics in mouse embryonic stem cells 
Translated title:
Stochastische und deterministische Methoden für die Analyse von Nanog Dynamik in embryonalen Stammzellen der Maus 
Year:
2016 
Document type:
Dissertation 
Institution:
Fakultät für Mathematik 
Advisor:
Theis, Fabian J. (Prof. Dr. Dr.) 
Referee:
Theis, Fabian J. (Prof. Dr. Dr.); Sbalzarini, Ivo F. (Prof. Dr.) 
Language:
en 
Subject group:
BIO Biowissenschaften; MAT Mathematik 
Keywords:
Nanog, Embryonic Stem Cel,l Gene Expression, Stochastic Autoregulation Model 
Translated keywords:
Nanog, Embryonale Stammzelle, Genexpression, Stochastisch, Autoregulation Modell 
TUM classification:
BIO 110d; MAT 022d 
Abstract:
Nanog is a key regulator of pluripotency in mouse embryonic stem cells (mESCs). In this thesis I present analysis of Nanog dynamics including transitions between fluorescence intensity compartments, oscillations, and onsets of Nanog expression. I present evidence for mESC subpopulations differing in expression dynamics and pluripotency factor correlation structures. I then develop mechanistic models for onset dynamics and a tree-based Bayesian inference algorithm for stochastic autoregulatory...    »
 
Translated abstract:
Nanog ist ein Pluripotenz-Hauptregulator in embryonalen Stammzellen der Maus (mESCs). In dieser Dissertation analysiere ich die Dynamik der Nanog Fluoreszenz, einschließlich Übergänge zwischen Intensitätskompartmenten, Oszillationen und der Entstehung von Nanog Exprimierung. Ich zeige, dass sich mESC Subpopulationen in ihrer Exprimierungsdynamik und Korrelationsstrukturen unterscheiden. Desweiteren entwickele ich mechanistische Modelle für die Enstehungsdynamik und einen baumbasierten Inferen...    »
 
Oral examination:
14.03.2016 
File size:
18207969 bytes 
Pages:
194 
Last change:
14.04.2016