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Original title:
Inference of Large Phylogenetic Trees on Parallel Architectures 
Translated title:
Berechnung großer phylogenetischer Bäume auf parallelen Architekturen 
Year:
2010 
Document type:
Dissertation 
Institution:
Fakultät für Informatik 
Advisor:
Bode, Arndt (Prof. Dr.) 
Referee:
Stamatakis, Alexandros (Dr.) 
Language:
en 
Subject group:
DAT Datenverarbeitung, Informatik 
Keywords:
Phylogenetic Trees, Maximum Likelihood, Parallel Tree Inference 
Translated keywords:
Phylogenetische Bäume, Maximum Likelihood, Parallelisierung 
Abstract:
Due to high computational demands, the inference of large phylogenetic trees from molecular sequence data requires the use of HPC systems in order to obtain the necessary computational power and memory. The continuous explosive accumulation of molecular data, which is driven by the development of cost-effective sequencing techniques, amplifies this requirement additionally. Furthermore, a continuously increasing degree of parallelism is necessary in order to exploit the performance of emerging m...    »
 
Translated abstract:
Aufgrund des sehr hohen Bedarfs an Rechenleistung und Arbeitsspeicher erfordert die Berechnung großer phylogenetischer Bäume aus molekularen Sequenzdaten die Verwendung von Hochleistungsrechnern. Diese Anforderungen werden zusätzlich durch die stetig wachsende Menge von molekularen Daten erhöht, die durch neuartige Sequenzierungs-Technologien kosteneffizient gewonnen werden können. Darüber hinaus erfordern aktuelle und zukünftige Mehrkern-Prozessoren einen immer höheren Grad an Parallelität, um...    »
 
Oral examination:
28.10.2010 
File size:
1093933 bytes 
Pages:
135 
Last change:
24.11.2010