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Original title:
Prediction and analysis of microRNAs and their targets in eukaryotic genomes 
Translated title:
Vorhersage und Analyse von microRNAs und deren Bindestellen in eukaryotischen Genomen 
Year:
2010 
Document type:
Dissertation 
Institution:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan 
Advisor:
Frischmann, Dimitri (Prof. Dr.) 
Referee:
Frischmann, Dimitri (Prof. Dr.); Mewes, Hans-Werner (Prof. Dr.) 
Language:
en 
Subject group:
BIO Biowissenschaften 
Keywords:
microRNA, Machine Learning, target sites, prediction 
Translated keywords:
microRNA, Machine Learning, target sites, prediction 
Abstract:
MicroRNAs are ~22 nucleotide long RNA molecules. They play a critical role in eukaryotic gene regulation by binding to the mRNA of protein coding genes mediating posttranscriptional repression. In this work experimentally verified microRNAs and their binding sites were analyzed and thereon the machine learning based prediction tools MiRanalyzer (http://web.bioinformatics.cicbiogune.es/microRNA/) and TargetSpy (http://www.targetspy.org) were developed. The former enables the detection of known an...    »
 
Translated abstract:
MicroRNAs sind endogene ~22 Nukleotid lange RNA Moleküle. Sie spielen eine wichtige Rolle in der eukaryotischen Genregulation, indem sie durch Anlagerung an die mRNA proteinkodierender Gene posttranskriptionelle Repression bewirken. In dieser Arbeit wurden experimentell verifizierte microRNAs und deren Bindestellen analysiert und in Folge basierend auf Machine Learning die Vorhersageprogramme MiRanalyzer (http://web.bioinformatics.cicbiogune.es/microRNA/) und TargetSpy (http://www.targetspy.org)...    »
 
Oral examination:
21.07.2010 
Pages:
119 
Last change:
10.08.2010