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Original title:
Single-cell transcriptomics and fate-mapping combined with mathematical modelling reveal mechanisms of CD8+ T cell differentiation and exhaustion
Translated title:
Einzelzelltranskriptomik und -Nachkommenschaften in Kombination mit mathematischer Modellierung enthüllen die Mechanismen der Differenzierung und Erschöpfung von CD8+ T-Zellen
Author:
Toska, Albulena
Year:
2022
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät für Medizin
Advisor:
Floßdorf, Michael (Dr.)
Referee:
Floßdorf, Michael (Dr.); Zehn, Dietmar (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
MED Medizin
TUM classification:
MED 450; MED 335
Abstract:
In this thesis, the fate decisions of T cells leading to functional or exhausted subsets are investigated at the single-cell level. Cell cycle speed measurements, single-cell fate-mapping, and single-cell transcriptome data inform and complement the mathematical modelling. Here we find that T cell differentiation follows a progressive scheme and that exhaustion represents a parallel path that deviates from the canonical differentiation programme early in the expansion phase.
Translated abstract:
In dieser Arbeit werden die T-Zell Schicksalsentscheidungen, die zu funktionalen oder erschöpften Subpopulationen führen, auf Einzelzellebene untersucht. Messungen der Zellzyklusgeschwindigkeit und Einzelzellnachkommenschaften, sowie Einzelzelltranskriptomdaten informieren die mathematische Modellierung. Wir zeigen, dass die T-Zell Differenzierung einem einheitlichen Schema folgt und dass die Erschöpfung einen parallelen Weg darstellt, der bereits früh in der Expansionsphase vom normalen Differe...     »
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1621651
Date of submission:
05.10.2021
Oral examination:
28.04.2022
File size:
15706049 bytes
Pages:
177
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20220428-1621651-1-0
Last change:
27.04.2024
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