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- Original title:
- Development of a Novel Target Enrichment and Barcoding Method for Next-Generation Sequencing, and Implementation for Single-Cell Transcriptomics
- Translated title:
- Entwicklung einer neuartigen Methode zur Target-Anreicherung und Barcoding für Next-Generation Sequenzierung, und Implementierung für die Einzelzelltranskriptomik
- Author:
- Uzbaş, Fatma
- Year:
- 2020
- Document type:
- Dissertation
- Faculty/School:
- Fakultät für Medizin
- Advisor:
- Lickert, Heiko (Prof. Dr.)
- Referee:
- Lickert, Heiko (Prof. Dr.); Wurst, Wolfgang (Prof. Dr.)
- Language:
- en
- Subject group:
- MED Medizin
- Keywords:
- barcoding, single-cell RNA sequencing, targeted transcriptomics, targeted genomics, high-throughput screening, human pluripotent stem cells, multiplex PCR
- Translated keywords:
- Barcoding, Einzelzell-RNA-Sequenzierung, gezielte Transkriptomik, gezielte Genomik, Hochdurchsatz-Screening, humane pluripotente Stammzellen, Multiplex-PCR
- Abstract:
- This thesis describes the development of a novel method (BART-Seq) for enriching selected genomic/transcriptomic loci and barcoding for next-generation sequencing to analyze tens of loci in thousands of samples in parallel. It can be performed with basic laboratory equipment and reagents. The method is applicable also to single-cells, and addresses the limitations of existing single-cell RNA-Seq techniques by offering increased coverage, quantitative measurements, and cost-efficiency.
- Translated abstract:
- Diese Dissertation beschreibt die Entwicklung einer neuen Methode (BART-Seq) zur Anreicherung ausgewählter genomischer/transkriptomischer Loci und zum Barcoding für Next-Generation Sequenzierung, um Dutzende Loci in Tausenden von Proben parallel zu analysieren. Es kann mit grundlegenden Laborgeräten und Reagenzien durchgeführt werden. Das Verfahren ist auch auf Einzelzellen anwendbar und begegnet den Einschränkungen bestehender Einzelzellen-RNA-Seq-Techniken, indem es eine verbesserte Abdeckung,... »
- WWW:
- https://mediatum.ub.tum.de/?id=1522654
- Date of submission:
- 11.11.2019
- Oral examination:
- 28.09.2020
- File size:
- 26711254 bytes
- Pages:
- 141
- Urn (citeable URL):
- https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20200928-1522654-1-9
- Last change:
- 05.11.2020
BibTeX