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- Original title:
- MiMiC- A computational method for automated generation of minimal microbial consortia based on functional metagenomic profiles
- Translated title:
- MiMiC- Eine computerbasierte Methode zur automatischen Erzeugung von minimalen Mikroorganismen-Konsortien basierend auf funktionellen metagenomischen Profilen
- Author:
- Kumar, Neeraj
- Year:
- 2021
- Document type:
- Dissertation
- Faculty/School:
- TUM School of Life Sciences
- Advisor:
- Haller, Dirk (Prof. Dr.)
- Referee:
- Haller, Dirk (Prof. Dr.); Clavel, Thomas (Prof. Dr.)
- Language:
- en
- Subject group:
- OEK Ökotrophologie, Ernährungswissenschaft
- TUM classification:
- OEK 161
- Abstract:
- Environmental and host-associated microbial communities are complex ecosystems. It is challenging to study community dynamics and thus important to create model systems of reduced complexity. Here we present “MiMiC” (Minimal Microbial Consortia), a bioinformatic approach that derives the composition of the original metagenomic community into a minimal microbial consortium that represents main functionalities of the ecosystem.
- Translated abstract:
- Umwelt- und wirtsassoziierte Mikroorganismen-Gemeinschaften sind komplexe Ökosysteme. Untersuchungen der Gruppendynamik sind daher sehr anspruchsvoll, weshalb Modellsysteme mit reduzierter Komplexität erstellt werden müssen. Nachfolgend stellen wir “MiMiC” (Minimal Microbial Consortia) vor, einen bioinformatischen Ansatz, der ein minimales mikrobielles Konsortium, das die Hauptfunktionen des Ökosystems darstellt, von der ursprünglichen metagenomischen Gemeinschaft ableitet.
- WWW:
- https://mediatum.ub.tum.de/?id=1602127
- Date of submission:
- 14.04.2021
- Oral examination:
- 23.09.2021
- File size:
- 10777488 bytes
- Pages:
- 102
- Urn (citeable URL):
- https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20210923-1602127-1-4
- Last change:
- 22.12.2021
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