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Originaltitel:
New Approaches in Context-based Protein Function Prediction 
Übersetzter Titel:
Neue Ansätze in kontext-basierter Gen Funktionsvorhersage 
Jahr:
2005 
Dokumenttyp:
Dissertation 
Institution:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan 
Betreuer:
Langosch, D. (Univ.-Prof. Dr.rer.nat.habil.) 
Gutachter:
Mewes, H.-W. (Univ.-Prof. Dr.rer.nat.); Dandekar, T. (Univ.-Prof. Dr.med.) 
Format:
Text 
Sprache:
en 
Fachgebiet:
BIO Biowissenschaften 
Stichworte:
bioinformatics; genomics; functional prediction; gene order 
Übersetzte Stichworte:
Bioinformatik; Genomik; Funktionsvorhersage 
TU-Systematik:
BIO 180d; BIO 175d; BIO 110d; BIO 040d 
Kurzfassung:
In this work we analyze genomic neighborhood of a gene as a source of functional information. Using concept of Similarity-Neighborhood graph we show presence of non-trivial relations between genomic neighbors in the context of several genomes. We also show that while for prokaryotes the existence of such relations can be deduced from the operonic organization of prokaryotic genomes, these relations can also be detected in the eukaryotic genomes where such organization is not common (with notable...    »
 
Übersetzte Kurzfassung:
Wir untersuchen genomische Nachbarschaft as eine Quelle funktioneller Informationen über Gene. Basierend auf dem Konzept von Simlarity-Neighborhood Graphen wird gezeigt, wie nicht-triviale Verhältnisse zwischen benachbarten Genen aufgedeckt werden können. Während in Prokaryoten das Vorhandensein solcher Korrelationen auf die Operonstrukturen zurückverfolgt werden kann, wurde dieses Phänomen auch in einigen eukaryontischen Genomen entdeckt, wo Operone in der Regel nicht vorkommen. Wir demonstrier...    »
 
Veröffentlichung:
Universitätsbibliothek der TU München 
Mündliche Prüfung:
18.04.2005 
Schlagworte:
Genanalyse Verwandtschaftserkennung Phylogenie Datenverarbeitung Methode 
Dateigröße:
3813524 bytes 
Seiten:
78 
Letzte Änderung:
13.03.2006