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Original title:
Theoretische Untersuchungen zur Elektrostatik bakterieller Porine und zur Anionentranslokation im Porin Omp32 
Translated title:
Computational Studies on the Electrostatic Properties of Bacterial Porins and on the Translocation of Anions in the Porin Omp32 
Year:
2004 
Document type:
Dissertation 
Institution:
Fakultät für Chemie 
Advisor:
Baumeister, Wolfgang (Hon.-Prof. Dr.) 
Referee:
Kessler, Horst (Prof. Dr. Dr. h.c.); Weinkauf, Sevil (Prof. Dr.) 
Format:
Text 
Language:
de 
Subject group:
CHE Chemie 
Keywords:
Porin; Omp32; Poisson-Boltzmann-Rechnungen; MD-Simulationen; Substratbindung 
Translated keywords:
Porin; Omp32; Poisson-Boltzmann calculations; MD simulations; substrate binding 
Controlled terms:
Porin; Ionentransport; Elektrostatik; Boltzmann-Gleichung; Poisson-Gleichung; Membranproteine; Ionenleitung; Molekulardesign 
TUM classification:
CHE 802d; CHE 820d; CHE 026d; CHE 142d 
Abstract:
In der vorliegenden Arbeit wurden die Titrationseigenschaften der ionisierbaren Gruppen aller unspezifischen Porine berechnet. Dabei wurde ein in allen Strukturen konserviertes Stabilisierungsmotiv der Ladung im Bereich der engsten Porenregion gefunden, das bedeutende funktionelle Relevanz besitzt. Die Untersuchung der Anionenleitung im Porin Omp32 mittels Moleküldynamiksimulationen führte zur Beschreibung eines neuen, eigenständigen Mechanismus der Ionentranslokation durch ein Kanalprotein. Das...    »
 
Translated abstract:
In this study, the titration properties of the ionizable groups of all unspecific porins were calculated. A motif stabilizing the charges in the narrowest pore region was found which has significant relevance for the function of the porins. An investigation of anion transfer through the porin Omp32 by Molecular Dynamics simulations led to the observation of a novel and unique mechanism of ion translocation through a channel protein. The corresponding free energy profile exhibits a number of bind...    »
 
Publication :
Universitätsbibliothek der TU München 
Oral examination:
11.08.2004 
File size:
8618396 bytes 
Pages:
153 
Last change:
13.06.2007