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Original title:
Predicting the structural effect upon single amino acid exchange 
Translated title:
Vorhersage des strukturellen Effekts aufgrund von Aminosäureaustausch 
Year:
2013 
Document type:
Dissertation 
Institution:
Fakultät für Informatik 
Advisor:
Rost, Burkhard (Prof. Dr.) 
Referee:
Rost, Burkhard (Prof. Dr.); Frischmann, Dimitri (Prof. Dr.) 
Language:
en 
Subject group:
BIO Biowissenschaften 
Controlled terms:
SNP; Mutation; Maschinelles Lernen 
TUM classification:
BIO 110d; DAT 708d 
Abstract:
Of particular interest in personalized medicine are mutations that result in a different amino acid (non-synonymous single nucleotide polymorphisms, nsSNPs) in the gene product since they could lead to molecular effects and disease. Here, we studied effects occurring on amino acid change in protein structure. A first coarse-grained analysis revealed a highly dynamic behavior of secondary structure and protein disorder. Furthermore, we developed a machine-learning model that successfully pre...    »
 
Translated abstract:
Von besonderem Interesse in personalisierter Medizin sind Mutationen, die die Aminosäure in einem Protein ändern (non-synonymous single nucleotide polymorphisms, nsSNPs) und zu molekularen Effekten und Krankheiten führen. Hier untersuchten wir diese Effekte in Protein Strukturen. Eine erste grobe Analyse zeigte ein dynamisches Verhalten von Sekundärstruktur und Protein Disorder. Desweiteren entwickelten wir ein Machine-Learning Modell, das erfolgreich den strukturellen Effekt aufgrund einer...    »
 
Oral examination:
28.01.2013 
File size:
11453841 bytes 
Pages:
112 
Last change:
05.12.2013