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Original title:
A highly scalable system for genome based computational microbial diagnostics 
Translated title:
Ein skalierendes System für die Genom-basierte rechnergestützte mikrobielle Diagnostik 
Year:
2012 
Document type:
Dissertation 
Institution:
Fakultät für Informatik 
Advisor:
Bode, Arndt (Prof. Dr.) 
Referee:
Bode, Arndt (Prof. Dr.); Rost, Burkhard (Prof. Dr.) 
Language:
en 
Subject group:
BIO Biowissenschaften; DAT Datenverarbeitung, Informatik 
Keywords:
dna, index, signature, genome 
Translated keywords:
DNA, Index, Signatur, Genom 
Controlled terms:
Nucleotidsequenz; Mikroorganismus; Framework Informatik 
TUM classification:
BIO 110d; DAT 332d 
Abstract:
In-silico primer/probe design based on nucleic acid genome sequence data is of great interest in research and economy concerning microbial diagnostics. Facing the extremely fast growth of available genome sequence data, a scalable integrated system for primer/probe design has been developed within this thesis. It is based on a framework for efficient retrieval and management of sequence and annotation data from different heterogeneous sources and a new memory independent genome sequence index st...    »
 
Translated abstract:
Rechnergestütztes Primer/Sonden-Design basierend auf Nukleinsäure Genomsequenzen ist von großem Interesse für die mikrobielle Diagnostik in Forschung und Wirtschaft. Mit Blick auf das extrem schnelle Wachstum der verfügbaren Genomsequenzen wurde ein skalierbares, integriertes System zum Primer/Sonden-Design entwickelt. Es basiert auf einem Framework zum effizienten Zugriff auf Genomdaten aus verschiedenen heterogenen Quellen sowie einer neuen speicherunabhängigen Genomsequenz-Indexstruktur, die...    »
 
Oral examination:
26.10.2012 
File size:
913568 bytes 
Pages:
140 
Last change:
28.11.2013