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Original title:
Folded Bio-Polymers – Structure, Pulling and Diffusion 
Translated title:
Gefaltete Biopolymere – Struktur, Ziehen und Diffusion 
Year:
2011 
Document type:
Dissertation 
Institution:
Fakultät für Physik 
Advisor:
Netz, Roland (Prof. Dr.) 
Referee:
Stark, Holger (Prof. Dr.); Netz, Roland (Prof. Dr.) 
Language:
en 
Subject group:
PHY Physik 
Abstract:
In this work denaturation transitions of nucleic acids and bio-polymers in and out of equilibrium are studied theoretically. First, the over-stretching transition of DNA is modeled successfully by a three-state model, which allows to disentangle effects of the stacking energy of base pairs and the loop free energy. Second, the thermodynamics of RNA folding is studied: A marked dependence on the parameterization of loops, which are a common theme in folded RNA structures, and on salt concentratio...    »
 
Translated abstract:
Diese Arbeit behandelt Denaturierungsübergänge von Nukleinsäuren und Biopolymeren im Gleichgewicht und Nichtgleichgewicht. Zunächst wird der Überdehnungsübergang bei DNA durch ein Dreizustandsmodell erfolgreich beschrieben, welches es ermöglicht die Einflüsse der Stapelwechselwirkung von Basenpaaren und der Schleifenentropie zu trennen. Im Anschluss wird der Einfluss der Parametrisierung von Schleifen, ein häufig auftretendes Motiv in RNA-Strukturen, und der Salzkonzentration auf die Thermodynam...    »
 
Oral examination:
27.01.2011 
File size:
5050063 bytes 
Pages:
155 
Last change:
22.02.2011