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Original title:
Bayesian model inference in dynamic biological systems using Markov Chain Monte Carlo methods 
Translated title:
Bayesianische Modellinferenz dynamischer biologischer Systeme unter Verwendung von Markov-Chain-Monte-Carlo-Verfahren 
Year:
2012 
Document type:
Dissertation 
Institution:
Fakultät für Mathematik 
Advisor:
Theis, Fabian J. (Prof. Dr. Dr.) 
Referee:
Theis, Fabian J. (Prof. Dr. Dr.); Czado, Claudia (Prof., Ph.D.); Tresch, Achim (Prof. Dr.) 
Language:
en 
Subject group:
MAT Mathematik 
Keywords:
Bayesian model inference, MCMC, Copula 
Translated keywords:
Bayesianische Modellinferenz, MCMC, Copula 
Controlled terms:
Bayes-Inferenz; Dynamisches System; Biologisches System; Markov-Ketten-Monte-Carlo-Verfahren 
TUM classification:
MAT 625d; MAT 629d 
Abstract:
Dynamical systems are a valuable tool for exploring the regulatory organization of living organisms on a molecular level. Here, Markov Chain Monte Carlo (MCMC) methods are often times used for model and parameter inference. We develop an (adaptive) copula based Metropolis-Hastings sampling scheme for efficient model inference of differential equation based dynamical systems. The concept exploits a vine copula decomposition of the estimated posterior distribution in order to generate efficient MC...    »
 
Translated abstract:
Dynamische Systeme sind nützliche Hilfsmittel zur Erforschung der molekularen Funktionsweise lebender Organismen. Markov-Chain-Monte-Carlo-Verfahren bieten hierbei einen differenzierten Ansatz zur Schätzung von Reaktionsparametern und Modellselektion. Wir entwickeln einen (adaptiven) Metropolis-Hastings-Algorithmus zur effizienten Modellinferenz von differentialgleichungsbasierten Systemen. Das Konzept nutzt die Vine-Copula-Zerlegung einer approximierten Posteriori-Verteilung zur Erzeugung von S...    »
 
Oral examination:
11.09.2012 
File size:
21752016 bytes 
Pages:
220 
Last change:
17.04.2013