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Original title:
The Mechanics of DNA: Theoretical and Computational Studies 
Translated title:
Die Mechanik der DNA: Theoretische und Rechnergestützte Untersuchungen 
Year:
2020 
Document type:
Dissertation 
Institution:
Fakultät für Physik 
Advisor:
Zacharias, Martin (Prof. Dr.) 
Referee:
Zacharias, Martin (Prof. Dr.); Gerland, Ulrich (Prof. Dr.) 
Language:
en 
Subject group:
BIO Biowissenschaften; DAT Datenverarbeitung, Informatik; PHY Physik 
TUM classification:
PHY 820d 
Abstract:
The mechanics of DNA is central to the regulation of many biological processes. Within this thesis, I have performed Molecular Dynamics simulations to study DNA mechanics at the atomic level and femtosecond time resolution. Besides, I have realized theoretical concepts and conducted quantum mechanical calculations to develop new methods. In particular, the development of a new DNA force field and a coarse-grained model for double-stranded DNA facilitates explorations from new perspectives. 
Translated abstract:
Die Mechanik der DNA ist von zentraler Bedeutung für viele biologische Prozesse. In dieser Arbeit habe ich Molekulardynamiksimulationen angewandt, um die Mechanik der DNA auf atomarer Femtosekunden Zeitauflösung zu untersuchen. Des Weiteren habe ich theoretische Konzepte verwirklicht und quantenmechanische Berechnung durchgeführt, woraus neue Methoden entwickelt wurden. Insbesondere die Entwicklung eines neuen DNA-Kraftfeldes und eines vergröberten mechanischen Models für doppelsträngige DNA erm...    »
 
Oral examination:
27.11.2020 
File size:
89348852 bytes 
Pages:
207 
Last change:
22.01.2021