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Original title:
The Mechanics of DNA: Theoretical and Computational Studies
Translated title:
Die Mechanik der DNA: Theoretische und Rechnergestützte Untersuchungen
Author:
Liebl, Korbinian
Year:
2020
Document type:
Dissertation
Institution:
Fakultät für Physik
Advisor:
Zacharias, Martin (Prof. Dr.)
Referee:
Zacharias, Martin (Prof. Dr.); Gerland, Ulrich (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften; DAT Datenverarbeitung, Informatik; PHY Physik
TUM classification:
PHY 820d
Abstract:
The mechanics of DNA is central to the regulation of many biological processes. Within this thesis, I have performed Molecular Dynamics simulations to study DNA mechanics at the atomic level and femtosecond time resolution. Besides, I have realized theoretical concepts and conducted quantum mechanical calculations to develop new methods. In particular, the development of a new DNA force field and a coarse-grained model for double-stranded DNA facilitates explorations from new perspectives.
Translated abstract:
Die Mechanik der DNA ist von zentraler Bedeutung für viele biologische Prozesse. In dieser Arbeit habe ich Molekulardynamiksimulationen angewandt, um die Mechanik der DNA auf atomarer Femtosekunden Zeitauflösung zu untersuchen. Des Weiteren habe ich theoretische Konzepte verwirklicht und quantenmechanische Berechnung durchgeführt, woraus neue Methoden entwickelt wurden. Insbesondere die Entwicklung eines neuen DNA-Kraftfeldes und eines vergröberten mechanischen Models für doppelsträngige DNA erm... »
Date of submission:
30.09.2020
Oral examination:
27.11.2020
File size:
89348852 bytes
Pages:
207
Last change:
22.01.2021
BibTeXOccurrences: