Microbial communities, consisting, for instance, of bacteria, archaea, and yeasts are often determined using sequencing of the 16S and 18S rRNA, respectively, and subsequent comparison with databases. Here, different methods producing short, long, or synthetic full-length sequences were either enhanced or newly established, tested, and compared, using, e.g., artificial mock communities, human stool, and cow milk. The developments made allow improved accuracy of the classification, estimation of the comparability of studies, and using samples with low amounts of organisms.      «

Microbial communities, consisting, for instance, of bacteria, archaea, and yeasts are often determined using sequencing of the 16S and 18S rRNA, respectively, and subsequent comparison with databases. Here, different methods producing short, long, or synthetic full-length sequences were either enhanced or newly established, tested, and compared, using, e.g., artificial mock communities, human stool, and cow milk. The developments made allow improved accuracy of the classification, estimation of...     »

Mikrobielle Gemeinschaften von z.B. Bakterien, Archaeen und Hefen werden oft über Sequenzierungen der 16S bzw. 18S rRNS und nachfolgende Datenbankvergleiche bestimmt. Hier wurden verschiedene Methoden, die kurze, lange oder synthetische Volllängen-Sequenzierfragmente erzeugen, entweder verbessert oder neu entworfen und getestet. Dazu wurden Proben wie z.B. künstliche Gemeinschaften, humaner Stuhl und Kuhmilchproben herangezogen. Die erzielten Fortschritte erlauben nun eine verbesserte Genauigkeit in der Artbestimmung, eine Beurteilung in der Vergleichbarkeit von Studien, und die Verwendung von Proben mit sehr wenigen Organismen.     «

Mikrobielle Gemeinschaften von z.B. Bakterien, Archaeen und Hefen werden oft über Sequenzierungen der 16S bzw. 18S rRNS und nachfolgende Datenbankvergleiche bestimmt. Hier wurden verschiedene Methoden, die kurze, lange oder synthetische Volllängen-Sequenzierfragmente erzeugen, entweder verbessert oder neu entworfen und getestet. Dazu wurden Proben wie z.B. künstliche Gemeinschaften, humaner Stuhl und Kuhmilchproben herangezogen. Die erzielten Fortschritte erlauben nun eine verbesserte Genauigkei...     »