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Original title:
Bioinformatic analysis of integrated Arabidopsis thaliana protein interaction networks
Translated title:
Bioinformatische Analyse von integrierten Arabidopsis thaliana Protein-Interaktionsnetzwerken
Author:
Altmann, Stefan
Year:
2019
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
Advisor:
Schwechheimer, Claus (Prof. Dr.)
Referee:
Schwechheimer, Claus (Prof. Dr.); Falter-Braun, Pascal (Prof. Dr.); Rattei, Thomas (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften
TUM classification:
BIO 400d
Abstract:
Protein-protein interactions are involved in most biological processes and form large networks. In this thesis, the bioinformatic analyses of two systematic Arabidopsis thaliana protein interaction networks are described. The analysis of the network of proteins involved in phytohormone signaling revealed a hierarchical topology, which reflected biological processes. Moreover, a dense interconnectedness between distinct pathways was found. The examination of interactions between effector proteins of three pathogens and Arabidopsis host proteins revealed a convergence of effector proteins on common host proteins.
Translated abstract:
Protein-Protein-Interaktionen sind an den meisten biologischen Prozessen beteiligt und bilden große Netzwerke. In dieser Arbeit werden die bioinformatischen Analysen von zwei systematischen Arabidopsis thaliana Protein-Interaktionsnetzwerken beschrieben. Die Analyse des Netzwerks von Proteinen, die an der Phytohormon-Signalübertragung beteiligt sind, ergab eine hierarchische Topologie, die biologische Prozesse widerspiegelte. Darüber hinaus wurde eine dichte Vernetzung zwischen verschiedenen Signalwegen festgestellt. Die Untersuchung der Interaktionen zwischen Effektorproteinen von drei Krankheitserregern und Arabidopsis-Wirtsproteinen ergab eine Konvergenz von Effektorproteinen auf gemeinsame Wirtsproteine.
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1510106
Date of submission:
27.06.2019
Oral examination:
13.11.2019
File size:
9687265 bytes
Pages:
259
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20191113-1510106-1-4
Last change:
01.11.2021
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