Functional characterization of overlapping genes in the food-borne pathogen Escherichia coli O157:H7
Translated title:
Funktionelle Charakterisierung von überlappenden Genen in dem Lebensmittelpathogenem Escherichia coli O157:H7
Author:
Fellner, Lea
Year:
2015
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
Advisor:
Scherer, Siegfried (Prof. Dr.)
Referee:
Scherer, Siegfried (Prof. Dr.); Liebl, Wolfgang (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften
TUM classification:
BIO 260d
Abstract:
Overlapping genes share the same DNA segment, but encode different proteins. Only few overlapping genes in bacteria have been described so far. In this work overlapping genes in pathogenic Escherichia coli were experimentally investigated. Overlapping open reading frames were translationally arrested. Some of these mutants showed a phenotype which is clear evidence for functional overlapping genes. Additionally, the genome of strain E.coli O157:H7 EDL933 used in this work was re-sequenced.
Translated abstract:
Überlappende Gene teilen sich das gleiche DNS-Segment, codieren aber für unterschiedliche Proteine. Bisher sind nur wenige überlappende Gene in Bakterien bekannt. In dieser Arbeit wurden überlappende Gene in pathogenem Escherichia coli experimentell untersucht. Dazu wurden überlappende offene Leserahmen translational arretiert. Einige Mutanten zeigten einen Phänotyp, was ein klarer Hinweis auf funktionale überlappende Gene ist. Zusätzlich wurde das Genom des für diese Arbeit verwendeten Stammes E.coli O157:H7 EDL933 re-sequenziert.
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