The focus of this work was on the structural characterization of important cell cycle proteins in particular those whose deregulation is associated with cancers including HDACs, CDKs and IGFBPs. HDAC deregulation plays a key role in cancer cell growth. HDAC inhibition has been shown to enhance transcription of a set of genes (2-5%) that includes tumour suppressor genes. In this study the crystal structure of the HDAC homolog HDLP was solved in complex with a novel HDACI. The second part of the study involved cloning, expression and purification of specific 15N labeled mammalian CDK6 from insect cells. In the final part we studied the proteolytic cleavage pattern of IGFBPs with the calpain. In conclusion, we propose that calpains seem not to recognize amino acid sequences in target proteins but cleave with low sequence specificity at unstructured or solvent exposed fragments.     «

The focus of this work was on the structural characterization of important cell cycle proteins in particular those whose deregulation is associated with cancers including HDACs, CDKs and IGFBPs. HDAC deregulation plays a key role in cancer cell growth. HDAC inhibition has been shown to enhance transcription of a set of genes (2-5%) that includes tumour suppressor genes. In this study the crystal structure of the HDAC homolog HDLP was solved in complex with a novel HDACI. The second part of the s...     »

Im dieser Arbeit wurde die struktur wichtiger Proteine des Zellzyklus untersucht. Darunter Proteine, deren Deregulation mit Krebs in Verbindung steht, wie z. B.: HDACs, CDKs und IGFBPs. Die HDAC-Deregulation spielt eine Schlüsselrolle im Wachstum von Krebszellen und die HDAC-Inhibierung verstärkt die Transkription einer Reihe von Genen (2-5% des gesamten Genoms), darunter auch Tumor-Suppressor-Gene. In dieser Arbeit wurde die Kristallstruktur des HDAC-Homologs HDLP im Komplex mit einem neuen HDACI gelöst. Der 2.Teil die Klonierung, Expression und Aufreinigung von humanem CDK6 aus Insektenzellen mit 15N-markierten Aminosäuren. Im letzten Teil wurde eine Analyse der proteolytischen Spaltung von IGFBPs mit Calpain durchgeführt. Aus den erhaltenen Ergebnissen wurde gefolgert, dass Calpaine keine bestimmten Aminosäuresequenzen im Zielprotein erkennen, sondern dieses mit geringer Sequenzspezifität in eher unstrukturierten bzw. dem Lösungsmittel exponierten Bereichen des Proteins spalten.     «

Im dieser Arbeit wurde die struktur wichtiger Proteine des Zellzyklus untersucht. Darunter Proteine, deren Deregulation mit Krebs in Verbindung steht, wie z. B.: HDACs, CDKs und IGFBPs. Die HDAC-Deregulation spielt eine Schlüsselrolle im Wachstum von Krebszellen und die HDAC-Inhibierung verstärkt die Transkription einer Reihe von Genen (2-5% des gesamten Genoms), darunter auch Tumor-Suppressor-Gene. In dieser Arbeit wurde die Kristallstruktur des HDAC-Homologs HDLP im Komplex mit einem neuen HDA...     »