Entwicklung rechnergestützter Methoden für die Strukturanalyse von Makromolekülen durch die Kryoelektronentomographie

Hrabe, Thomas

Thomas Hrabe

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Original title:: Entwicklung rechnergestützter Methoden für die Strukturanalyse von Makromolekülen durch die Kryoelektronentomographie
Translated title:: Development of computational methods for structural analysis of macromolecules imaged by cryo electron tomography
Author:: Hrabe, Thomas
Year:: 2012
Document type:: Dissertation
Faculty/School:: Fakultät für Chemie
Advisor:: Baumeister, Wolfgang (Prof. Dr.)
Referee:: Baumeister, Wolfgang (Prof. Dr.); Weinkauf, Sevil (Prof. Dr.)
Language:: de
Subject group:: BIO Biowissenschaften; CHE Chemie; DAT Datenverarbeitung, Informatik
Keywords:: Kryoelektronentomographie, Strukturanalyse, Subtomogram, Mittelung, tomographische Datenverarbeitung
Translated keywords:: Cryo Electron Tomography, Structural Analysis, Subtomogram, Averaging
Abstract:: In dieser Arbeit wurde die Software-Plattform PyTom für die strukturelle Analyse von Makromolekülen mittels der Kryoelektronentomographie entwickelt. PyTom enthält für die Verarbeitung von Tomogrammen alle notwendigen Prozesse, sowie neue Methoden für das Ausrichten und die Mittelung von Subtomogrammen, welche die Genauigkeit gegenüber klassischen Methoden verbessern. Ergebnisse basierend auf simulierten sowie experimentellen Tomogrammen verifizieren die Zuverlässigkeit der entwickelten Methoden. «
In dieser Arbeit wurde die Software-Plattform PyTom für die strukturelle Analyse von Makromolekülen mittels der Kryoelektronentomographie entwickelt. PyTom enthält für die Verarbeitung von Tomogrammen alle notwendigen Prozesse, sowie neue Methoden für das Ausrichten und die Mittelung von Subtomogrammen, welche die Genauigkeit gegenüber klassischen Methoden verbessern. Ergebnisse basierend auf simulierten sowie experimentellen Tomogrammen verifizieren die Zuverlässigkeit der entwickelten Metho... »
Translated abstract:: The software-platform PyTom developed in this work provides procedures for the structural analysis of macromolecules imaged by cryo electron tomography. PyTom includes all steps required for processing tomograms and furthermore includes new methods for the alignment and averaging of subtomograms. Results determined on simulated and experimental tomograms reveal robustness of all implemented methods.
WWW:: https://mediatum.ub.tum.de/?id=1106199
Date of submission:: 02.05.2012
Oral examination:: 20.07.2012
File size:: 9863109 bytes
Pages:: 103
Urn (citeable URL):: https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20120720-1106199-1-9
Last change:: 03.08.2012
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