Im Rahmen dieser Arbeit wurde eine differentielle Proteom- und Glykoproteomanalyse von Ewingsarkom- (und deren Subtypen) und Neuroblastomzelllinien durchgeführt, um potentielle Biomarker für beide Tumorarten zu detektieren. Es konnten 13 tumorspezifische Proteine, davon 3 Glykoproteine nachgewiesen und identifiziert werden. Die differentielle Proteomanalyse von zwei Ewingsarkom-Subtypen ergab 27 identifizierte, subtypen-spezifische Proteine. Desweiteren wurden methodische Arbeiten zur Anreicherung von niedrig abundanten Proteinen mit pIs > 7 mithilfe von Trägerampholyt-Gradienten in Sepharose-Flachbettgelen durchgeführt. Es konnte mithilfe dieser Methode 32 Proteine erstmalig auf 2D-Gelen nachgewiesen werden. Ein weiterer Aspekt war die Optimierung der isoelektrischen Fokussierung (IEF) in immobilisierten pH-Gradienten (IPGs) von integralen Membranproteinen. Hier konnte erstmalig das integrale Membranprotein Bacteriorhodopsin durch 2D-Elektrophorese mit vorhergehender IEF durch IPG getrennt werden.     «

Im Rahmen dieser Arbeit wurde eine differentielle Proteom- und Glykoproteomanalyse von Ewingsarkom- (und deren Subtypen) und Neuroblastomzelllinien durchgeführt, um potentielle Biomarker für beide Tumorarten zu detektieren. Es konnten 13 tumorspezifische Proteine, davon 3 Glykoproteine nachgewiesen und identifiziert werden. Die differentielle Proteomanalyse von zwei Ewingsarkom-Subtypen ergab 27 identifizierte, subtypen-spezifische Proteine. Desweiteren wurden methodische Arbeiten zur Anreicheru...     »

In this work a differential proteome analysis of Ewing sarcoma and Neuroblastoma cell lines was performed to detect candidate biomarkers for both tumor types. A total of 13 tumor specific proteins, thereof 3 glycoproteins, could be found and identified. It was also investigated which proteins between two subtypes of Ewing sarcomas are differentially expressed, where 27 proteins were identified. A further part of this work was to develop a method for the prefractionation of low-abundant proteins with a pI > 7. This method enabled to detect 32 proteins for the first time on 2D gels. Another part of this work was the optimization of isoelectric focussing (IEF) of integral membrane proteins in immobilized pH gradients (IPGs), where it was possible to separate the integral membrane protein Bacteriorhodopsin on a 2D gel with prior IEF by IPG for the first time.     «

In this work a differential proteome analysis of Ewing sarcoma and Neuroblastoma cell lines was performed to detect candidate biomarkers for both tumor types. A total of 13 tumor specific proteins, thereof 3 glycoproteins, could be found and identified. It was also investigated which proteins between two subtypes of Ewing sarcomas are differentially expressed, where 27 proteins were identified. A further part of this work was to develop a method for the prefractionation of low-abundant proteins...     »