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Original title:
Sequence-based prediction reveals effect of protein-, DNA- RNA-binding residues on sequence variants
Translated title:
Die sequenzbasierte Vorhersage zeigt die Wirkung von Protein-, DNA-RNA-Bindungsresten auf Sequenzvarianten
Year:
2021
Document type:
Dissertation
Institution:
Fakultät für Informatik
Advisor:
Rost, Burkhard (Prof. Dr.)
Referee:
Rost, Burkhard (Prof. Dr.); Kramer, Stefan (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
INF Informationswesen, Bibliotheks-, Dokumentations-, Archiv-, Museumswesen
TUM classification:
BIO 110
Abstract:
Goal of this thesis was to complete a high-throughput analysis of how binding residues affect genetic variants and vice versa. First, we developed of a new and comprehensive system (named ProNA2020) that takes only protein sequence as input. Then it was applied to the analysis of SAVs from 60,706 people. This revealed that SAVs on macro-molecular binding residues have more effect on protein functions. Overall, this novel research about binding residues might benefit future research in molecular...    »
Translated abstract:
Ziel dieser Arbeit war es, eine Hochdurchsatzanalyse durchzuführen, wie Bindungsreste genetische Varianten beeinflussen und umgekehrt. Zunächst haben wir ein neues und umfassendes System (ProNA2020) entwickelt, das nur die Proteinsequenz als Eingabe verwendet. Dann wurde es auf die Analyse von SAVs von 60.706 Personen angewendet. Dies zeigte, dass SAVs auf makromolekularen Bindungsresten einen größeren Einfluss auf die Proteinfunktionen haben. Insgesamt könnte diese neuartige Forschung über Bind...    »
Date of submission:
21.10.2020
Oral examination:
25.01.2021
File size:
26318120 bytes
Pages:
106
Last change:
10.05.2021
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