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- Originaltitel:
- Comparative transcriptomics and translatomics to identify novel overlapping genes, active hypothetical genes, and ncRNAs in Escherichia coli O157:H7 EDL933
- Übersetzter Titel:
- Differentielle Transkriptom- und Translatomanalysen zur Identifizierung von neuen überlappenden Genen, aktiven hypothetischen Genen und ncRNAs in Escherichia coli O157:H7 EDL933
- Autor:
- Landstorfer, Richard Benedikt
- Jahr:
- 2014
- Dokumenttyp:
- Dissertation
- Fakultät/School:
- Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
- Betreuer:
- Prof. Dr. Siegfried Scherer
- Gutachter:
- Scherer, Siegfried (Prof. Dr.); Keim, Daniel (Prof. Dr.); Liebl, Wolfgang (Prof. Dr.)
- Sprache:
- en
- Fachgebiet:
- BIO Biowissenschaften
- Kurzfassung:
- Enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 EDL933 (EHEC) is an emerging food-borne pathogen. Strand specific RNA sequencing of this strain under various environmental conditions and ribosomal footprinting was applied to distinguish translated and untranslated transcripts. The study revealed that many hypothetical genes are only active under environmental conditions, e.g., on radish sprouts. Additionally, new ncRNAs, non-annotated genes, and numerous overlapping genes could be verified, indicatin... »
- Übersetzte Kurzfassung:
- Enterohämorrhagische Escherichia coli O157:H7 EDL933 (EHEC) sind durch Nahrungsmittel übertragene Krankheitserreger. EDL933 wurde in Transkriptomsequenzierungen unter Umweltbedingungen und mittels Translatomsequenzierung analysiert. Viele als hypothetisch annotierte Gene waren nur unter Umweltbedingungen, z.B. auf Rettichsprossen, aktiv. Durch die Differenzierung von Transkriptom und Translatom konnten neue ncRNAs, bisher unbekannte Gene und zahlreiche überlappende Gene nachgewiesen werden. Dies... »
- ISBN:
- 978-3-00-046930-5
- WWW:
- https://mediatum.ub.tum.de/?id=1187202
- Eingereicht am:
- 18.12.2013
- Mündliche Prüfung:
- 27.06.2014
- Dateigröße:
- 6812376 bytes
- Seiten:
- 156
- Letzte Änderung:
- 15.09.2014
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