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Originaltitel:
Cross species common gene regulatory network inference
Übersetzter Titel:
Inferenz speziesübergreifender Genregulationsnetzwerke
Autor:
Moghaddas Gholami, Amin
Jahr:
2011
Dokumenttyp:
Dissertation
Fakultät/School:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
Betreuer:
Küster, Bernhard (Prof. Dr.)
Gutachter:
Frischmann, Dimitri (Prof. Dr.); Küster, Bernhard (Prof. Dr.)
Sprache:
en
Fachgebiet:
BIO Biowissenschaften; DAT Datenverarbeitung, Informatik
Stichworte:
systems biology, gene regulatory networks, integrating data, reverse engineering, cross species, network inference
Übersetzte Stichworte:
Systembiologie, Genregulationsnetzwerke, Datenintegration, Reverse Engineering, speziesübergreifend, Netzwerk Inferenz
Schlagworte (SWD):
Bioinformatik; Systembiologie; Genregulation ; Bayes-Netz; Reverse Engineering; Datenintegration
TU-Systematik:
BIO 110d; BIO 120d
Kurzfassung:
High-throughput genomic and proteomic techniques are widely used to increase our understanding of cellular processes. My algorithm merges such datasets on the basis of co-expression alone, without any requirement for orthology information. Combining existing methods such as co-inertia analysis, back-transformation, Hungarian matching and majority voting the algorithm affiliates genes and experiments at the same time. The resulting cross-species dynamic Bayesian gene networks improve on the netwo...     »
Übersetzte Kurzfassung:
Hochdurchsatzverfahren in Genomik und Proteomik tragen grundlegend zum besseren Verständnis zellulärer Prozesse bei. Mein Algorithmus fusioniert resultierende Datensätze allein auf der Basis gemeinsamer Expressionsmuster, auch völlig ohne Zuhilfenahme von Vorabwissen z. B. über Orthologie. Er wurde durch Zusammenführen geeigneter bereits existierender Methoden als Module wie z. B. Koinertia-Analyse, Rücktransformation der Projektionskoordinaten, ungarischer Methode und Mehrheitswahl erarbeitet....     »
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1006112
Eingereicht am:
13.12.2010
Mündliche Prüfung:
15.02.2011
Dateigröße:
3677373 bytes
Seiten:
159
Urn (Zitierfähige URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20110215-1006112-1-2
Letzte Änderung:
28.04.2011
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