User: Guest  Login
Original title:
Global Donor and Acceptor Splicing Site Kinetics in Human Cells
Translated title:
Umfassende Donor- und Acceptorkinetik in menschlichen Zellen
Author:
Wachutka, Leonhard
Year:
2020
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät für Informatik
Advisor:
Gagneur, Julien (Prof. Dr.)
Referee:
Gagneur, Julien (Prof. Dr.); Friedel, Caroline (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
PHY Physik
Abstract:
Using Transient Transcriptome sequencing (TT-seq) enabled, for the first time, the genome-wide quantification of the half-lives of individual donor site and acceptor site bonds as well as the rate of formation of splice junctions. A systematic search for genetic predictors of the splicing processes showed that the donor site cleavage time is limited by polymerase elongation and allowed for estimating the interaction effects between several spliceosome components and the RNA at single nucleotide...     »
Translated abstract:
Mithilfe von Transient Transcriptome sequencing (TT-seq) ist es uns erstmals gelungen die Halbwertszeiten von Donor- und Acceptor- Bindungsstellen, sowie deren Syntheseraten, auf der Ebene einzelner Ester-Bindungen zu messen. Eine gründliche Untersuchung der kinetischen Splicing-Parameter zeigte, dass die Halbwertszeit eines Donors durch die Elongation von Pol II limitiert ist. Ferner konnten wir die Interaktionen zwischen den verschiedenen Komponenten des Spliceosomes und der RNA auf molekulare...     »
Series:
Selected Topics of Electronics and Micromechatronics
Series volume:
52
ISBN:
978-3-8440-7710-0
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1546733
Date of submission:
27.05.2020
Oral examination:
10.09.2020
Last change:
25.02.2021
 BibTeX