Conformational Dynamics and Mechanisms of RNA Recognition by the Multidomain Splicing Factor U2AF
Translated title:
Konformationelle Dynamik und Mechanismen der RNA-Bindung des Multidomänenspleißfaktors U2AF
Author:
Sánchez Rico, Carolina
Year:
2017
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät für Chemie
Advisor:
Sattler, Michael (Prof. Dr.)
Referee:
Sattler, Michael (Prof. Dr.); Reif, Bernd (Prof. Dr.); Förster, Friedrich (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
CHE Chemie
Keywords:
U2AF, NMR, spliceosome assembly
Translated keywords:
U2AF, NMR, Spleißosomassemblierung
TUM classification:
CHE 808d; CHE 244d
Abstract:
Molecular mechanisms of RNA recognition by the essential splicing factor U2AF are studied by NMR, SAXS and FRET. The tandem RNA binding domains of U2AF65 adopt an ensemble of inactive conformations. RNA binding by U2AF65 is proofread by an autoinhibitory interaction of the linker connecting the RRM domains. The presence of U2AF35 induces an open state of U2AF65 in the absence of RNA and thereby favors the binding of weak Py-tracts, consistent with its role in spliceosome assembly.
Translated abstract:
Mechanismen der RNA Bindung des essentiellen Spleißfaktors U2AF wurden mittels NMR, SAXS und FRET untersucht. Die RNA bindenden Tandemdomänen von U2AF65 bilden ein Ensemble inaktiver Konformationen. U2AF65s RNA-Bindung wird durch eine autoinhibitorische Interaktion des Linkers korrekturgelesen. Die Gegenwart von U2AF35 induziert den offenen Zustand von U2AF65 auch ohne gebundene RNA und erleichtert so die Bindung schwacher Py-Stränge, konsistent mit seiner Rolle in der Spleißosomassemblierung.
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