Liebl, Wolfgang (Prof. Dr.); Ludwig, Wolfgang (Dr.)
Referee:
Liebl, Wolfgang (Prof. Dr.); Haller, Dirk (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften
Keywords:
gut microbiome, FACS, in situ hybridization, polynucleotide probe
Translated keywords:
Darm Mikrobiom, FACS, in situ Hybridisierung, Polynukleotid-Sonde
TUM classification:
BIO 250d
Abstract:
Elucidating the composition and genetics of gut microbiota under various conditions is essential to understand how microbes function individually and as a community. The in-depth analysis of certain subpopulations could offer new perspectives, e.g. in therapeutic developments. Here, we established a new variant of fluorescence in situ hybridization combined with flow cytometry (FISH-FACS) which uses polynucleotide probes. The technique provides access to taxon-specific genomes, e.g. of Enterococcus spp. belonging to the complex community of the intestinal microbiota.
Translated abstract:
Um Veränderungen in der Zusammensetzung / Genetik des intestinalen Mikrobioms unter gewissen Bedingungen zu verstehen, ist es notwendig den funktionellen Anteil einzelner Mikroorganismen bzw. Populationen detailliert zu untersuchen. Dies könnte neue Kenntnisse, z.B. für therapeutische Anwendungen erbringen. In dieser Arbeit wurde ein Verfahren etabliert, das unter Verwendung von Polynukleotid-Sonden die Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierungsmethode mit der Durchflusszytometrie kombiniert (FISH-FACS). Die neu entwickelte Methode ermöglicht es, das taxon-spezifische Sub-Metagenom von z.B. Enterococcus spp. innerhalb des komplexen intestinalen Mikrobioms zugänglich zu machen.
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