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Original title:
High-performance approaches to the comprehensive computation and evaluation of signatures in bacterial sequence datasets
Translated title:
Hochperformante Verfahren zur umfassenden Berechnung und Bewertung von Signaturen in bakteriellen Sequenzdatensätzen
Year:
2013
Document type:
Dissertation
Institution:
Fakultät für Informatik
Advisor:
Grothoff, Christian (Ph.D.)
Referee:
Grothoff, Christian (Ph.D.); Bode, Arndt (Prof. Dr.); Rost, Burkhard (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften
TUM classification:
BIO 110d
Abstract:
Oligonucleotide primers and probes are key diagnostic agents of today's molecular diagnostic methods. Two new algorithms have been developed which help to improve the search and evaluation step of suitable binding sites of primers and probes on genetic material. They allow the rapid sensitive and specific identification of individual organisms or groups based on large sequence data sets and phylogenetic trees.
Translated abstract:
Oligonukleotid-Primer und -Sonden sind zentrale Bestandteile heutiger molekularer Diagnostikverfahren. Zwei neue Algorithmen wurden entwickelt, welche zur Verbesserung des Such- und Evaluierungsschrittes von geeigneten Bindungsstellen von Primern und Sonden auf genetischen Material beitragen. Sie ermöglichen die rasche sensitive und spezifische Identifizierung von einzelnen Organismen oder Gruppen basierend auf großen Sequenzdatensätzen und phylogenetischen Bäumen.
Date of submission:
01.10.2012
Oral examination:
15.04.2013
File size:
3031926 bytes
Pages:
174
Last change:
22.11.2013
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