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Original title:
Studying the dynamics of stochastic biochemical processes using generalised moment closure approximations 
Translated title:
Untersuchung der Dynamik stochastisch-biochemischer Prozesse mit Hilfe von verallgemeinerten Moment-Closure-Approximationen 
Year:
2018 
Document type:
Dissertation 
Institution:
Fakultät für Mathematik 
Advisor:
Theis, Fabian (Prof. Dr.) 
Referee:
Theis, Fabian (Prof. Dr.); Claassen, Manfred (Prof. Dr.); Junge, Oliver (Prof. Dr.) 
Language:
en 
Subject group:
BIO Biowissenschaften; MAT Mathematik 
Keywords:
Stochastic biochemical kinetics; Chemical Reaction Networks; Mesoscopic modelling of biological processes; Chemical Master Equation; Moment Equations; Parameter Estimation 
TUM classification:
BIO 110d; MAT 022d 
Abstract:
This thesis aims to establish robust, reliable and feasible mesoscopic approximative methods that can be used in the formalism of systems biology to learn about the underlying mechanisms of stochastic biochemical processes. One of the main contributions of this work is proposing a model reduction, based on the topological structure of the reaction network, that enables mesoscopic modelling of large-scale biological processes. In addition, a simulation platform was developed as a part of this the...    »
 
Translated abstract:
Ziel dieser Dissertation ist es, zugleich robuste, zuverlässige und realisierbare mesoskopische Näherungsverfahren zu schaffen. Diese können auf biochemische Systeme angewendet werden, um mehr über ihre stochastische Natur zu lernen. Einer der Hauptbeiträge dieser Arbeit ist die Ausarbeitung einer Modell-Reduktion, die auf der topologischen Struktur des Reaktionsnetzwerks basiert. Sie ermöglicht eine mesoskopische Modellierung von umfangreichen biologischen Prozessen. Des Weiteren wurde eine Sim...    »
 
Oral examination:
11.07.2018 
File size:
11124742 bytes 
Pages:
126 
Last change:
24.08.2018