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Original title:
Fast Structure Searching for Computational Proteomics 
Translated title:
Schnelle Struktursuche für computer-basierte Proteomforschung 
Year:
2007 
Document type:
Dissertation 
Institution:
Fakultät für Informatik 
Advisor:
Mayr, Ernst W. (Prof. Dr.) 
Referee:
Brauer, Wilfried (Prof. Dr. Dr. h.c. mult.) 
Language:
en 
Subject group:
DAT Datenverarbeitung, Informatik 
Keywords:
protein structure, database searching, index 
Translated keywords:
Proteinstruktur, Datenbanksuche, Index 
Abstract:
Proteins are among the most important organic compounds. The vast number of their functions are based on the specific effect of their various structures. To investigate the principles of protein structure and function experimentally determined structures were collected in the Protein Data Bank since 1971. Searching in this database is essential for protein research. At the moment, the only way to perform a search in an acceptable amount of time is by sequence or as a full-text search.
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Translated abstract:
Zu den wichtigsten Stoffklassen aller Organismen zählen die Proteine. Deren vielfältige Funktionen basieren auf der spezifischen Wirkung ihrer diversen Strukturen. Um die Prinzipien von Aufbau und Wirkung der Proteine zu untersuchen, wurden experimentell ermittelte Strukturen seit 1971 in der Protein Data Bank erfasst. Die Suche in dieser Datenbank ist essentiell für die Proteinforschung. Sie ist derzeit jedoch nur auf Basis der Sequenz oder als Textsuche in akzeptabler Zeit möglich.
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Oral examination:
27.04.2007 
Pages:
183 
Last change:
29.08.2007