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Original title:
Analyse konservierter Nachbarschaftsbeziehungen in vollständig sequenzierten Genomen 
Translated title:
Analysis of conserved neigborhood relationships in completely sequenced genomes 
Year:
2007 
Document type:
Dissertation 
Institution:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan 
Advisor:
Mewes, Hans-Werner (Prof. Dr.) 
Referee:
Parsch, John (Prof. Dr.) 
Language:
de 
Subject group:
BIO Biowissenschaften; DAT Datenverarbeitung, Informatik 
Keywords:
Bioinformatik, Genomanalyse, segmentale Duplikationen, Syntenie, Kontext basierte Funktionsvorhersage 
Translated keywords:
bioinformatics, genome analysis, segmental duplications, synteny, context based functional prediction 
Controlled terms:
Genanalyse; Genom; Syntenie 
TUM classification:
BIO 180d; BIO 110d 
Abstract:
Durch die Sequenzierung des Genoms eines Organismus steht die vollständige Information über die relative Anordnung einzelner genetischer Objekte zur Verfügung. Die vorgelegte Arbeit analysiert diese Daten in Hinblick auf Gruppen gleichartiger Objekte, die mehrfach in Nachbarschaft zueinander auftreten. Dabei werden drei unterschiedliche Ebenen betrachtet. Auf Ebene der DNA-Sequenz dient die Analyse der Identifizierung segmentaler Duplikationen in Arabidopsis thaliana. Auf Gen-Ebene übertragen fu...    »
 
Translated abstract:
A genome sequence provides the complete information regarding the relative order of single genetic elements. The work presented here analyzed these data in order to identify groups of equal objects, which are repeatedly found in close neighborhood to each other. Within the scope of this study, three different levels got considered for an analysis. On the DNA sequence level, the analysis identified segmental duplications in Arabidopsis thaliana. Transferred to the gene level, the method performs...    »
 
Oral examination:
10.10.2007 
Pages:
119 
Last change:
02.05.2008