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Original title:
Development and Integration of Structure Based Visualization Tools in ARB Software Package 
Translated title:
Entwicklung und Integration von Werkzeugen für die strukturbasierte Visualisierung im ARB Softwarepaket 
Year:
2006 
Document type:
Dissertation 
Institution:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan 
Advisor:
Ludwig, Wolfgang (Dr. rer. nat.) 
Referee:
Schleifer, Karl-Heinz (Prof. Dr. rer. nat.); Kramer, Stefan (Prof. Dr.) 
Format:
Text 
Language:
en 
Subject group:
DAT Datenverarbeitung, Informatik; BIO Biowissenschaften 
Keywords:
ARB; ribosomal RNA; sequence analysis; rRNA structures; molecular phylogeny; Visualization; oligonucleotide probes 
Translated keywords:
ARB; ribosomaler RNS; Sequenzanalysen; rRNS-Strukturen; phylogenetische analysen; Hybridisierungssonden; Visualisierung 
Abstract:
Ribosomal RNA, a key molecule in protein synthesis with its ubiquitous presence and highly conserved nature has formed the backbone of modern molecular taxonomy. Owing to the functional constraints, the structural features exhibited by rRNA are highly conserved across the entire breadth of life. Consideration of such structural features during alignment of rRNA genes will greatly improve the quality of the alignment and help generating biologically meaningful evolutionary relationships between r...    »
 
Translated abstract:
Vergleichende Sequenzanalysen ribosomaler RNS haben die molekulare Taxonomie geprägt. Die Konserviertheit der rRNS-Strukturen zeigt sich wegen des funktionellen Selektionsdruckes in der gesamten Vielfalt der Lebensformen. Die Berücksichtigung dieser Strukturen verbessert deutlich die Qualität von Sequenzalignments und die Ableitung phylogenetischer Beziehungen. Verschiedene grafische Werkzeuge, die eingehende, auf Strukturelementen basierende vergleichende Analysen von rRNS-Genen erleichtern, wu...    »
 
Publication :
Universitätsbibliothek der Technischen Universität München 
Oral examination:
13.01.2006 
File size:
7598104 bytes 
Pages:
113 
Last change:
27.01.2006