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Original title:
Functional profiles of health: elucidating genetics and microbiome of human disease 
Translated title:
Funktionsprofile der Gesundheit: Eruieren von Genetik und Mikrobiom in menschlicher Krankheit 
Year:
2018 
Document type:
Dissertation 
Institution:
Fakultät für Informatik 
Advisor:
Rost, Burkhard (Prof. Dr.) 
Referee:
Rost, Burkhard (Prof. Dr.); Bromberg, Yana (Prof. Dr.) 
Language:
en 
Subject group:
BIO Biowissenschaften; DAT Datenverarbeitung, Informatik 
Keywords:
variant effect prediction, microbiome, human disease 
Translated keywords:
Mutationseffekt-Vorhersage, Mikrobiom, menschliche Krankheit 
TUM classification:
BIO 110d 
Abstract:
In this work, we developed new approaches to significantly improve identification of molecular malfunction patterns leading to disease. We introduced a new feature, characterizing protein sequence positions by the distribution of variant effects on protein function. For application in improved effect prediction, we implemented a Machine Learning approach predicting this feature with high accuracy. We further explored the microbiome perspective and designed tools that enable the analyses of micro...    »
 
Translated abstract:
Wir entwickelten neue Ansätze, um die Identifikation fehlerhafter molekularer Muster in Bezug auf Krankheiten signifikant zu verbessern. Ein neues Merkmal charakterisiert Positionen einer Proteinsequenz anhand der Verteilung von Mutations-Effekten auf Proteinfunktion. Zur verbesserten Effekt-Vorhersage verwendeten wir Machine Learning, um jenes mit hoher Präzision vorherzusagen. Aus Mikrobiom-Perspektive analysierten wir Metagenom-Funktions-Profile bezüglich Krankheitsstadien und evaluierten fun...    »
 
Oral examination:
14.03.2018 
File size:
15488252 bytes 
Pages:
95 
Last change:
14.03.2019