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Original title:
Viral mRNAs: evolution and structure-function relation 
Translated title:
Virale mRNAs: Evolution und Struktur-Funktions Zusammenhänge 
Year:
2019 
Document type:
Dissertation 
Institution:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan 
Advisor:
Frishman, Dmitrij (Prof. Dr.) 
Referee:
Frishman, Dmitrij (Prof. Dr.); Goultiaev, Alexandre (Prof. Dr.) 
Language:
en 
Subject group:
BIO Biowissenschaften 
Keywords:
mRNA structure; structure database; secondary structure; viral mRNA; subVOG; structurally related; RNA structure; structurally homogenous; structurally related; related mRNAs; 
Translated keywords:
mRNA structure; structure database; secondary structure; viral mRNA; subVOG; structurally related; RNA structure; structurally homogenous; structurally related; related mRNAs; 
TUM classification:
BIO 110d 
Abstract:
We investigated conserved RNA secondary structures in the intergenic regions of ambisense viruses and questioned their evolutionary relation. Furthermore the usage of structure prediction software, trained on non-coding genetic material was tested on protein coding regions. A further investigation was on the creation of a possibly complete census of conserved RNA secondary structures in the coding regions viral mRNAs and a corresponding web resource. 
Translated abstract:
Es wurden konservierte RNA Sekundärstrukturen innerhalb intergenischer Regionen von ambisense Viren untersucht, sowie die Anwendung von strukturvorhersage Methoden, welche mit nicht kodierenden genetischen Sequenzen trainiert wurden, auf Protein kodierenden Sequenzen getestet. In einer weiteren Analyse wurde eine möglicherweise vollständige Erhebung von konservierten RNA Sekundärstrukturen in kodierenden Regionen viraler mRNAs erstellt, sowie eine dazugehörige Web Ressource. 
Oral examination:
02.10.2019 
File size:
7528811 bytes 
Pages:
101 
Last change:
16.10.2019