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Original title:
From low-throughput SSR genotyping to high-throughput SNP analyses of natural populations: validation of their application focused on non-invasive samples 
Translated title:
Von der Niedrigdurchsatz-Genotypisierung von Mikrosatelliten hin zu Hochdurchsatz-SNP-Analysen natürlicher Populationen: Validierung ihrer Anwendung fokussiert auf non-invasives Probenmaterial 
Year:
2019 
Document type:
Dissertation 
Institution:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan 
Advisor:
Kühn, Ralph (Prof. Dr.) 
Referee:
Kühn, Ralph (Prof. Dr.); Geist, Jürgen (Prof. Dr.); Gula, Roman (Prof. Dr.) 
Language:
en 
Subject group:
BIO Biowissenschaften 
Keywords:
microsatellite, SSR, single nucleotide polymorphism, SNP, conservation genetics, non-invasive genetic sampling, Eurasian otter, Lutra lutra, RAMseq 
Translated keywords:
Mikrosatellit, SSR, Punktmutation, SNP, Naturschutzgenetik, non-invasive genetische Probenahme, Eurasischer Fischotter, Lutra lutra, RAMseq 
TUM classification:
BIO 700d 
Abstract:
Efficient genetics tools are needed to provide information on the genetic constitution of endangered species. DNA quantification as a means of quality assessment of non-invasive genetic samples and a novel approach of SNP detection in non-model species called Random Amplicon Sequencing (RAMseq) were developed. These were validated during a non-invasive genetic census of the Eurasian otter (Lutra lutra) and performance of developed SNP markers in population genetic analyses was compared to that o...    »
 
Translated abstract:
Effektive genetische Methoden werden benötigt, um Informationen über die genetische Konstitution bedrohter Arten zu erhalten. Die DNA-Quantifizierung zur Qualitätsbestimmung non-invasiver Proben und eine neue Methode zur Detektion von SNP Markern in nicht-Modelltierarten, Random Amplicon Sequencing (RAMseq), wurden entwickelt. Diese wurden während eines non-invasiven genetischen Zensus des Eurasischen Fischotters (Lutra lutra) validiert und die Effizienz der entwickelten SNP Marker mit der von e...    »
 
Oral examination:
26.09.2019 
File size:
8953739 bytes 
Pages:
199 
Last change:
05.12.2019