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Originaltitel:
Geometric Diffusions for Reconstruction of Cell Differentiation Dynamics 
Übersetzter Titel:
Rekonstruktion von Zelldifferenzierungsdynamiken mittels Geometrischer Diffusion 
Jahr:
2016 
Dokumenttyp:
Dissertation 
Institution:
Fakultät für Mathematik 
Betreuer:
Theis, Fabian J. (Prof. Dr. Dr.) 
Gutachter:
Theis, Fabian J. (Prof. Dr. Dr.); Fornasier, Massimo (Prof. Dr.); Maggioni, Mauro (Prof. Dr.) 
Sprache:
en 
Fachgebiet:
MAT Mathematik 
Stichworte:
Diffusion maps, Single-cell, differentiation, clustering, pseudotime 
TU-Systematik:
BIO 110d; MAT 022d 
Kurzfassung:
The temporal order of differentiating cells is intrinsically encoded in their single-cell expression profiles. In this dissertation an adaptation of geometric diffusions is proposed to robustly estimate this order. The developed method makes it possible to reconstruct the developmental progression of cells and identify transient or metastable states, branching decisions and differentiation endpoints. 
Übersetzte Kurzfassung:
Die zeitliche Anordnung von sich teilenden Zellen ist intrinsisch in ihren Einzelzell-Expressionsprofilen kodiert. In dieser Dissertation wird eine Erweiterung von Geometrischer Diffusion zur robusten Schätzung dieser Ordnung vorgeschlagen. Die entwickelte Methode ermöglicht die Rekonstruktion des Entwicklungsstadiums der Zellen, sowie die Identifikation von metastabilen Zuständen, Verzweigungen und Endpunkten des Entwicklungsprozesses. 
Mündliche Prüfung:
15.12.2016 
Dateigröße:
26310746 bytes 
Seiten:
138 
Letzte Änderung:
15.12.2017