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Originaltitel:
Sequence-based prediction of protein-protein interactions 
Übersetzter Titel:
Sequenzbasierte Vorhersage von Protein-Protein Interaktionen 
Jahr:
2014 
Dokumenttyp:
Dissertation 
Institution:
Fakultät für Informatik 
Betreuer:
Rost, Burkhard (Prof. Dr.) 
Gutachter:
Rost, Burkhard (Prof. Dr.); Frischmann, Dimitri (Prof. Dr.) 
Sprache:
en 
Fachgebiet:
BIO Biowissenschaften; DAT Datenverarbeitung, Informatik; INF Informationswesen, Bibliotheks-, Dokumentations-, Archiv-, Museumswesen 
Kurzfassung:
Understanding life on the molecular level requires knowledge about protein-protein interactions (PPIs), but experimental data is limited and complex, rendering computational methods indispensable. We first analyzed PPI interfaces in all known PPI structures and found surprising differences in binding modes. Then we developed a method based on artificial neural networks that predicts from sequence which amino acids interact in a PPI. Another new state-of-the-art method determines whether two prot...    »
 
Übersetzte Kurzfassung:
Um Leben auf molekularer Ebene zu verstehen brauchen wir Wissen über Protein-Protein Interaktionen (PPIs). Experimentelle Daten sind jedoch rar und kompliziert und machen computergestützte Methoden unverzichtbar. Diese Arbeit analysierte Proteinberührungsflachen in allen bekannt PPI Strukturen und fanden überraschende Unregelmäßigkeiten im Bindungsverhalten. Dann trainierten wir künstliche Neuronale Netze die nur anhand der Proteinsequenzen vorhersagen welche Aminosäuren in einer PPI interagiere...    »
 
Mündliche Prüfung:
18.06.2014 
Dateigröße:
15685991 bytes 
Seiten:
183 
Letzte Änderung:
31.12.2014