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Originaltitel:
Computational approaches to enhance mass spectrometry-based proteomics
Übersetzter Titel:
Neue Softwareentwicklungen für die massenspektrometrie-basierte Proteomforschung
Autor:
Neuhauser, Nadin
Jahr:
2013
Dokumenttyp:
Dissertation
Fakultät/School:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
Betreuer:
Frischmann, Dimitri (Prof. Dr.)
Gutachter:
Frischmann, Dimitri (Prof. Dr.); Mann, Matthias (Prof. Dr.)
Sprache:
en
Fachgebiet:
BIO Biowissenschaften; DAT Datenverarbeitung, Informatik
Stichworte:
bioinformatics, computational, proteomics, expert system, high performance computing, peptide search engine
Übersetzte Stichworte:
Bioinformatik, Datenverarbeitung, Proteomforschung, Expertensystem, Hochleistungsrechner, Peptide Suchmaschine
Kurzfassung:
In this thesis I present three computational approaches that improve the analysis of mass spectrometry-based proteomics data. The novel search engine Andromeda allows efficient identification of peptides and proteins. Implementation of a rule-based expert system provides more detailed information contained in the mass spectra. Furthermore I adapted our computational proteomics pipeline to high performance computers.
Übersetzte Kurzfassung:
In dieser Arbeit stelle ich drei neue bioinformatische Ansätze vor, die die Analyse massenspektrometrischer Proteomdaten verbessern. Die neu entwickelte Suchmaschine Andromeda identfiziert Peptide und Proteine effizienter als bisher. Ein regelbasiertes Expertensystem vervollständigt die Massenspektren automatisch mit detaillierten Informationen. Außerdem habe ich unsere Auswertungssoftware so angepasst, dass alle Funktionen auf Hochleistungsrechnern ausgeführt werden können.
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1136349
Eingereicht am:
07.03.2013
Mündliche Prüfung:
03.05.2013
Dateigröße:
12316246 bytes
Seiten:
125
Urn (Zitierfähige URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20130503-1136349-0-1
Letzte Änderung:
03.07.2014
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